据目前文献显示，坚持进食定量黑巧克力主要有预防感冒、降低血压、改善胰岛素敏感性、有益于心脏等好处。黑巧克力中含有大量的可可碱，具有扩张冠状动脉、兴奋心肌及松弛气管平滑肌等作用：而含有的名叫类黄酮的抗氧化剂，则具有促进血液循环、防止血液凝结的功效。另一种叫黄烷醇的抗氧化剂，能有效地抑制血管紧张素转化酶，从而可起到保护心脏的作用。

另外，胃肠道中存在特异的嗜黑巧克力微生物，可以将糖果中不能被消化的部分转化为具有抗炎作用的复合物，能预防或延缓一些与炎症相关的疾病，如心血管疾病的发生。近年的一些短期研究也提出黑巧克力可以引起血管扩张，降低血压，而在白巧克力和牛奶巧克力中没有发现类似现象。

不过，由于全世界可可豆产量极其有限，与市场产品数量不成比例，巧克力中真正的可可含量有待考究。而代可可品质与作用与天然可可相差甚远，因此享用美味的巧克力之前必须清楚产品说明书中其成分及含量。欧盟的标准是可可的含量大于35%称之为黑巧克力，可以接受的味道比例是50%～70%，比例越高味道越苦，口感也没有了柔滑。

巧克力中含有兴奋神经系统的物质，经常失眠、过敏的人不宜吃黑巧克力。